A jak próbujesz usunąć ręcznie (np. del z konsoli admina) którykolwiek z tych plików to jaki dostajesz komunikat? Dodatkowo spróbuj zobaczyć czy coś systemowego nie ma otwartego handlera do tych plików (również z konsoli administratora) - aplikacja handle.exe (http://technet.microsoft.com/en-us/sysinternals/bb896655.aspx), np.
handle C:\Windows\Temp\...\ntoskrnl.exe
Podaj również uprawnienia na tym pliku, np.
icacls C:\Windows\Temp\...\ntoskrnl.exe
Mógłbyś wrzucić logi: https://www.fixitpc.pl/forum-6/announcement-3-wa%C5%BCne-zak%C5%82adanie-tematu-obowi%C4%85zkowe-logi/?